Bioinformatics 관런 pakage를 이용하고 싶어, http://www.bioconductor.org/ pakage를 불러와 설치를 시도하였는데,
어떤 문제에서 인지 설치가 잘 되지 않습니다.
제 PC의 R studio에서는 잘 설치가 되는데 서버를 이용할때, 오류가 나서 이렇게 질문올립니다.!
그림첨부하니, 참고하시고 답변 부탁드리겠습니다.!!^^
Comment 3
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cardiomoon
2015.04.10 08:29
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Grant
2015.04.10 18:21
아 알겠습니다. ! 저도 R을 이제 막 시작했고, Bioinformatics를 공부하고 싶어 이것저것 시도하고 있는 상황이기 때문에, 서버에서 안되는부분은 아직 PC에서도 충분히 사용 가능할것 같습니다. PC와 sever 안에서는 CRAN Pakage 안에서 활용하면 충분할 것 같습니다.!!^^
이렇게 도움주시고, 이런 서버 사용할 수 있게 해주신것에 대해 정말 감사드립니다. 아직 학생의 신분으로 작은 후원금밖에 못드려 죄송할따름입니다.
감사합니다.!^^ -
DataDriven
2015.04.10 19:57
에러메시지에서 알려주는대로 실행해보셨나요? 제 Rstudio server 계정에서는 정상적으로 설치가 됩니다.
install.packages("BiocInstaller", repos="http://bioconductor.org/packages/3.0/bioc") 로 r패키지를 설치하시고
library(BiocInstaller) 로 r패키지를 불러오신다음
biocLite() 함수를 사용해서 원하시는 bioc패키지를 설치 하실 수 있는 것 같습니다.
?biocLite를 입력하시면 함수에 대한 자세한 설명을 보실 수 있습니다.
그런데 제가 biocLite(pkgs="GraphPAC")으로 테스트를 해보니
뭔가 굉장히 많이 설치가 되네요...ㅎㅎ 이런 실행결과가 나오는게 맞는지는 직접 확인해보시면 좋을 것 같습니다^^
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저도 RStudio Server를 처음 다루어서 잘은 모르겠지만 메모리가 적어서 인것 같습니다. 현재 web-r.org서버는 RAM이 4G입니다. 회원수가 많아지면 8G...16G로 upsize할 예정이나 아직 미정입니다. Grant 님이 원하시는 만큼의 서버의 성능이 따라가지 못해 죄송합니다. 만일 원하시면 후원금 환불해드리겠읍니다.