안녕하십니까?
"Survival" 패키기로 log-rank test를 시행하는데 아래와 같은 결과가 나왔습니다.
===================================
> #-- Progression Free Survival by Stage
> survdiff(Surv(T_PRG, O_PRG==1)~Stage, data=dset1)
Call:
survdiff(formula = Surv(T_PRG, O_PRG == 1) ~ Stage, data = dset1)
N Observed Expected (O-E)^2/E (O-E)^2/V
Stage=3 50 19 24.4 1.188 1.74
Stage=4 103 72 66.6 0.435 1.74
Chisq= 1.7 on 1 degrees of freedom, p= 0.2
==================================
위에서 P value가 0.2 로 소수점 한자리까지만 표시가 되는데, 혹시 소수점 둘째자리나 셋째자리까지 표시할 수 있는 방법이 있는지 궁금합니다.
감사합니다!
Comment 3
-
마술샘
2019.02.18 00:05
안녕하세요 마술샘입니다다른 부분은 쉽게 자료에 접근이 가능한데 p값은 접근이 어렵네요먼저 x2값에 접근하는 방법입니다 이 값도 소수점 한자리죠...survdiff(Surv(futime, fustat) ~ rx,data=ovarian)[["chisq"]]survdiff(Surv(time, status) ~ pat.karno + strata(inst), data=lung)[["chisq"]]그 다음이 p값의 접근인데... 이거는 직접 구해줘야 합니다명령어는 다음과 같습니다pchisq(여기에 x2입력, df=여기에 df입력, lower.tail=FALSE)df는 통계결과에 나옵니다...이를 조합하면pchisq(survdiff(Surv(futime, fustat) ~ rx,data=ovarian)[["chisq"]], df=1, lower.tail=FALSE)pchisq(survdiff(Surv(time, status) ~ pat.karno + strata(inst), data=lung)[["chisq"]], df=7, lower.tail=FALSE)그리고 소수점 3자리까지만 표기하고 싶으시면round(pchisq(survdiff(Surv(futime, fustat) ~ rx,data=ovarian)[["chisq"]], df=1, lower.tail=FALSE),3)round(pchisq(survdiff(Surv(time, status) ~ pat.karno + strata(inst), data=lung)[["chisq"]], df=7, lower.tail=FALSE),3)해당 예시는 기본 생존분석 예시입니다도움이 되셨으면 합니다... -
begabung
2019.02.21 21:09
복잡하지만... 상세하게 알려주셔서 성공했습니다! 감사합니다.
-
Moncher
2019.02.25 10:45
저도 도움 많이 받았습니다!
혹시 cox분석에서는 어떻게 하는게 좋을까요??
코드를 붙여서 해보니 잘 안 되는 것 같아서요 ㅎㅎ
| No. | Subject | Author | Date |
|---|---|---|---|
| 594 |
diagnostic accuracy
[1]  | 쑤니 | 2019.03.07 |
| 593 | 생존분석 질문입니다. [2] | 박소이 | 2019.03.06 |
| 592 | 표만들기 오류 [1] | 김밥친구 | 2019.03.03 |
| 591 | 변수선택 관련 질문 드립니다. [1] | chamchi | 2019.02.28 |
| 590 | forest plot 그리는 법 문의 드립니다. [1] | 강민정 | 2019.02.24 |
| 589 | matchIt 함수 사용시 질문 있습니다. [1] | YJK | 2019.02.23 |
| 588 |
ORplot 관련하여 질문드립니다.
| 매직하마 | 2019.02.23 |
| 587 | mytable 함수 에러 [3] | iddrlee | 2019.02.21 |
| 586 |
범주형 변수 생존 분석시 log rank와 cox univariate 결과 해석에 대해 질문 드립니다.
[1] | 소외 | 2019.02.20 |
| 585 | 회귀분석에서의 범주형변수 [4] | 에곤쉴레 | 2019.02.20 |
| » | Survdiff로 log-rank test 시 P-value 소수점 [3] | begabung | 2019.02.15 |
| 583 |
정회원 서버 신청 문의입니다.
[2]  | chl065512 | 2019.02.13 |
| 582 |
mytable 관련 질문드립니다
[3] | 낡은찻잔 | 2019.02.12 |
| 581 | web-R 기반 분석 후 다운로드 관련 문의점 | kato7 | 2019.02.11 |
| 580 | stepwise logistic 회귀에서 결측치 문제 질문드립니다. [2] | 매직하마 | 2019.02.10 |
| 579 |
데이터 업로드에 오류가 반복되어 생깁니다.
| kato7 | 2019.02.07 |
| 578 |
table 작성시 오류
| 김날 | 2019.02.07 |
| 577 | 문의 드립니다. [1] | 김날 | 2019.01.31 |
| 576 | 표 만들기에서 계속 error 가 납니다. [3] | 세희맘 | 2019.01.30 |
| 575 |
Risk scoring???
[1] | 홍성엽 | 2019.01.28 |